萨斯迦派在乌思藏的影响至元八年，八思巴离大都至临洮住夏，并在当地建寺传法。十一年三月启程前往拉萨，由真金太子率军护送，帝师之职由其异母弟亦怜真（Rinchenrgyal-mtshan）代理。途中八思巴还多次写信给元世祖问安，并祝贺元军攻克南宋诸城，劝戒行善止杀。并向真金讲解佛教教义，此即后来成书的《彰所知论》。十三年底抵萨斯迦，乌思藏地方掌管教法的格西与管理各地事务的首领，都前来相会。次年正月，在出密举行了有七万僧人参加的大法会，真金太子以元世祖的名义充当施主，扩大了萨斯迦派在乌思藏地方的影响。

　　八思巴在萨斯迦期间，对乌思藏地方的官员重新作了任命，免除了原来还是由他任命的公哥监卜（Kun-dgah-bzang-po）的本钦（dpon-chen）职务，以尚尊（ zhang-btsun） 代之。同时， 指定恰纳的遗腹子答耳麻八剌（Dharmapala-rakshita，1268—1287）为萨斯迦款氏家族与教主的继承人。这些措施在当时均引起一定的不满情绪。真金护送军返回后，矛盾尖锐。《汉藏史集》记“由于本钦公哥藏卜做了背信弃义之事，有人将此情奏报朝廷。皇帝顾念朝廷与萨斯迦派关系重大，遂决定予以护佑，派大臣桑哥（senggha）为首领，率蒙古大军前往究查”。桑哥率蒙古军七万及朵甘思（mDo-khams）和朵思麻（mDO-smad）军三万人，共十万人前往，迅速击败对抗者，处死公哥藏卜。嗣后，还拜见八思巴喇嘛。桑哥率军返回后不久，1280 年11月22 日，八思巴在萨斯迦中的拉康喇让中逝世，终年46 岁。“讣闻，赙赠有加，赐号皇天之下一人之上开教宣文辅治大圣至德普觉真智佑国如意大宝法王、西天佛子、大元帝师。”（《元史·释老传》）为之建大宰堵波于京师。至治年间（1321—1323），元英宗特诏郡县建庙通祀。泰定元年（1324），又以绘像十一幅，令各行省为之塑像，备极尊崇之礼。

　　帝师制度的沿袭八思巴是元代杰出的宗教活动家和社会活动家。他的一生对巩固元朝在吐蕃地方的统治，加强蒙、藏、畏兀儿、汉等民族的相互了解与团结，维护国家统一，保护佛教各派信仰自由，繁荣文化事业等方面，有过积极的贡献。由元世祖所确立的帝师制度也为元朝诸帝所沿袭，直至元亡。这一制度规定：帝师由萨斯迦一派掌握；由皇帝任命，总天下释教兼管吐蕃地方事务；荐举宣政院及乌思藏地方行政官员；为皇帝、皇子、后妃讲经说法，祈福祷寿，为护国安刹躬尽其力等。有元一代有帝师十四人，简介如下：（1） 八思巴（hphags-pa），1260—1270 年任国师，1270—1274 年任元世祖忽必烈的帝师。（2）亦怜真（rin-chenrgyal-mtshan，1238-1279 或1282），八思巴异母弟，萨斯迦款氏家族人。1274 年八思巴前往乌思藏，以其继任帝师，直至去世。

　　（3）答耳麻八剌剌吉塔（Dharmapala-rakshita，1268—1287），萨斯迦款氏家族人，白兰王恰纳朵儿只的遗腹子。1282 年任元世祖忽必烈的帝师至1286 年去职。1287 年卒于朵甘思。

　　（4）亦摄思连真（ye-shesrin-chen，1248—1294），八思巴弟子之东支，夏尔巴（Shar-pa）系统。1286 年继答耳麻八剌剌吉塔为元世祖忽必烈的帝师，至1291 年去职。

　　（5）乞剌斯八斡节儿（Grags-pahod-zer1246—1303），八思巴弟子的康赛（khan-gsar，萨斯迦新寺）传承，西夏王室后裔。自1291 年起先后为元世祖忽必烈、元成宗铁穆耳的帝师，直到去世。

　　（6）辇真监藏（Rin-chenrgyal-mtshan，1258—1305），八思巴弟子的东支传承。夏尔巴氏家族人，为第四任帝师亦摄思连真之弟。1304 年任元成宗铁穆耳的帝师，次年卒。

　　（7）相家班（sangs-rgyasdpal， 1267—1314），萨斯迦康赛传承，帝师乞剌斯八斡节儿侄，西夏王室后裔。从1305 年至1314 年先后任元成宗铁穆耳、元武宗海山及元仁宗爱育黎拔力八达的帝师。

　　（ 8 ） 公哥罗古罗思监藏班藏卜（ Kun-dgah blogrosrgyalmtshandpal-bzang-po，1299—1327），萨斯迦款氏家族人。自1315 年至1327年，先后任元仁宗爱育黎拔力八达、元英宗硕德八剌及元泰定帝也孙铁木儿的帝师。

　　（9）旺出儿监藏（dBang-phyugrgyal-mtshan，？—1325），家族出身不详。自1323 年至1325 年先后任元英宗硕德八剌和泰定帝也孙铁木儿的帝师。或云其为前任帝师公哥罗古罗思监藏班藏卜去萨斯迦期间代理帝师。（10）公哥列思八冲纳思监藏班藏卜（ Kun-dgahlegs-pahihbyung-gnasrgyal-mtshandpal-bzang-po， 1308-1330），萨斯迦款氏家族人，自1327 年至1330 年先后任元泰定帝也孙铁木儿、元幼主阿里吉八及元文宗图帖睦尔的帝师。